De onderzoeksprojecten komen er op initiatief van de onderzoekers. Twee types van onderzoeksproject kunnen worden toegekend: junior en seniorprojecten. Met deze projecten wil het FWO het fundamenteel wetenschappelijk onderzoek bevorderen. Dit gebeurt op initiatief van de onderzoekers in alle wetenschappelijke disciplines.
Het financieringsprogramma voor projecten fundamenteel onderzoek heeft tot doel onderzoek te ondersteunen dat fundamentele onderzoeksvragen wil beantwoorden. Het is gericht op onderzoek gedreven door wetenschappelijke nieuwsgierigheid, met als enige of hoofdzakelijke doelstelling het creëren van kennis, de ontwikkeling dus van nieuwe kennis waarbij men geen concrete praktische toepassing of gebruik op het oog heeft. Vragen over de valorisatie van de onderzoeksresultaten zijn geenszins verplicht of zelfs relevant. Onderzoek ondersteund door middel van dit programma is volledig gewijd aan het overschrijden van de grenzen van bestaande kennis, mogelijk maar niet noodzakelijk met reële wetenschappelijke doorbraken. Deze doorbraken kunnen de vorm aannemen van resultaten met grote potentiële impact, hetzij wetenschappelijk, economisch, maatschappelijk, cultureel en/of op andere manieren, en die bestaande kennis, paradigma’s, technologieën en/of structuren zouden kunnen transformeren of radicaal veranderen.
Gedurfde nieuwe ideeën die zich helemaal aan het begin van de O&O-cyclus situeren, zijn even welkom als onderzoek dat multi- of interdisciplinair is. Aanvragers stellen hun eigen onderwerpen voor (bottom-up), er worden geen thema’s opgelegd. De omvang van aanvragersteams kunnen variëren van individuele onderzoekers tot verbanden van meerdere partners. Het programma biedt dus zeker mogelijkheden tot samenwerking tussen onderzoeksteams binnen en zelfs (in meer beperkte mate) buiten Vlaanderen. Bi- of multilaterale projecten die structurele samenwerking met onderzoekers in een reeks andere landen in Europa omvatten, zijn mogelijk in het kader van het WEAVE-programma, dat geïntegreerd is in het programma voor de fundamentele projecten.
Om een gelijk speelveld te creëren, is het programma voor projecten fundamenteel onderzoek opgedeeld in een junior competitie, voor aanvragers met een postdoctorale senioriteit van niet meer dan 12 jaar, en een senior competitie voor aanvragers met een PhD postdoctorale senioriteit van meer dan 12 jaar.
Het programma voor fundamentele onderzoeksprojecten onderscheidt zich aldus van financieringsprogramma’s gericht op toegepast onderzoek (of experimentele ontwikkeling ) aan de ene kant en programma’s die strategisch basisonderzoek ondersteunen met innovatiepotentieel op lange termijn aan de andere kant.